Here is a list of the student projects that are currently available in my team.

For more information, send an email to m.dejager@uu.nl 

1. Project aanwaaiers (Dutch only, MSc project)

Project aanwaaiers is een public engagement activiteit waarin we scholen willen betrekken bij het onderzoek naar biodiversiteit.

 

Het project heeft twee doelen:

  1. Basisschoolkinderen (meer) in contact brengen met de natuur om hen heen, waarbij de kinderen bewustwording creëren van hoe wij de natuur om ons heen beïnvloeden;
  2. Data verzamelen over verspreiding van plantenzaden in gebieden die meer of minder verstedelijkt zijn.

 

Het is de bedoeling om ‘aanwaaiende’ planten (wat vaak gezien wordt als ‘onkruid’) te laten groeien in daarvoor bedoelde bakken met (gesteriliseerde) potgrond. De kinderen kunnen dan bijhouden wat er allemaal opkomt. Hoeveel verschillende soorten planten komen er te groeien? En in welke aantallen per soort? Door wekelijks foto’s te maken, kunnen de kinderen time-lapses maken van de groei van ‘hun’ plantjes.

 

Voor het onderzoek is het belangrijk om de omgeving van de scholen in kaart te brengen. Welke omgevingsfactoren zijn van belang voor gevonden verschillen in aantallen kiemplanten en biodiversiteit?   

 

Voor dit project zijn we op zoek naar twee studenten (die de Nederlandse taal goed beheersen). Er kan gewerkt worden aan:

  1. Het bouwen en vullen van een website, waarin per ‘onkruid’ beschreven wordt wat het voor functie heeft voor andere planten en dieren (bijvoorbeeld als waardplant of functioneel voor mensen).
  2. Het uitdenken van het experiment, het aanschrijven van basisscholen, en het aansturen van de startup van het project op de scholen.

2. The effects of habitat (de)fragmentation and dispersal on METE’s species abundance distribution estimation

With maximum entropy models, the species abundance distribution pattern of a healthy community can  be quite accurately described. Many communities are, however, not in a healthy state, as they are experiencing the effects of anthropogenic changes. One of these changes to the environment is severe habitat fragmentation. Due to habitat fragmentation, dispersal between communities becomes more difficult. Such dispersal limitation impairs gene flow and colonization by new species, amongst others. Furthermore, habitat fragmentation reduces population size and thereby can have additional effects, such as increasing genetic and ecological drift. To estimate the state of communities and their level of fragmentation, we examine changes in METE’s prediction of the species abundance distribution of simulated data. Using a simple individual-based model, we simulate community assembly and dynamics under changing fragmentation conditions.

 

This project involves modeling and data analysis in R (potentially rewriting the script to C++ or python).

3. the eco-evolutionary effects of habitat fragmentation and restoration on animal movement strategies 

In my 2023 Ecology and Evolution paper, I demonstrated that changing habitat fragmentation levels can cause evolutionary hysteresis in the dispersal capacity of water-dispersed plants. In this student project, we will investigate how increasing and decreasing habitat fragmentation levels change optimal animal search strategies. Using an individual-based model, students can focus on a wide range of parameters that may change the outcome of the model simulations.